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Equipe-Projet INRIA - Numed

Numerical Medicine

L'équipe-projet INRIA Numed est dirigée, depuis sa création en 2009, par Emmanuel GRENIER, Professeur de Mathématiques à l'ENS de Lyon.

Elle est hébergée au sein de l'Unité de Mathématiques Pures et Appliquées.

 

Membres

 

En septembre 2018:
Emmanuel Grenier, PR (Responsable de l'équipe)
David Coulette, IR CNRS
Hélène Leman, CR INRIA
Paul Vigneaux, MCF, HDR
 

Arthur Marly, Doctorant/AGPR

Nous avons par ailleurs la grande chance que Sylvie Boyer, responsable du Service des Assistantes des équipes INRIA de Lyon, gère aussi l'administration du projet Numed.

Collaborateurs extérieurs:
Vincent Calvez, DR CNRS & ICJ-Université Lyon 1 (après avoir été membre de Numed de 2009 à 2016)
François Ducray, Oncologue, Hospices Civils de Lyon & Université de Lyon
David Rousseau, PR, Creatis-INSA Lyon

 

Objectifs

 

Développer des modèles mathématiques complexes (équations aux dérivées partielles, systèmes dynamiques) permettant de simuler l'évolution de différentes pathologies (en particulier AVC et cancer) en intégrant des données hétérogènes à différentes échelles de l'organisme (voies moléculaires, cellule, tissu, organe, ...) et en tenant compte de la spatialité de ces phénomènes. Les techniques de simulations numériques couplées à des méthodes d'estimation de paramètres ont pour but de prédire et d'optimiser l'efficacité des stratégies thérapeutiques innovantes.

 

Publications

 

On pourra retrouver sur HAL les publications de l'équipe. (Lien pour l'année en cours)

 

Codes

 

On trouve ici des exemples conceptuels très simples illustrant le couplage entre Monolix et un modèle EDP quelconque mis au point par l'utilisateur/trice (voir l'article Grenier et al, M2AN 2014 pour la description méthodologique complète).

Download the Matlab scripts and tools of the example of KPP-Fisher equation (reaction-diffusion PDE).  monolix-edp-files.zip

 

Compléments

 

Site web INRIA (historique de l'EPI, rapports d'activité depuis 2009, etc).